李 云
个人简介
李云,男,重庆云阳人,理学博士,三级教授,博士生导师。西南大学第四届校学术委员会委员,西南大学第三届研究生教育指导专家委员会副主任委员。水产学科重庆市学术技术带头人,水产一级学科博士点水产养殖方向学术带头人,西南大学水产工程技术研究中心主任。先后在美国密歇根大学、西澳大利亚大学,泰国孔敬大学等多所大学访学和交流。
学术兼职
教育部高等学校水产类专业教学指导委员会委员(2013-2017),教育部普通高等学校教育教学评估专家,全国第四届农业专业学位研究生教育指导委员会渔业发展领域分委会委员,中国水产学会第十一届理事会淡水养殖分会委员,第一次全国水产养殖种质资源普查技术专家(西南区),重庆市水产科技创新联盟种业创新工作组组长。重庆市水产学会第五届理事会副理事长。
任国家科学技术奖,国家级人才计划,科技部、农业部国家重点研发计划项目评审专家,国家自然科学基金,国家留学基金评审专家;重庆、四川、湖北、江苏、浙江、广东、广西等省级科研项目和科技奖励评审专家;重庆市农业农村委渔业产业、涉渔工程生态环境影响评价专家。任《Fishes》 《淡水渔业》 《重庆水产》等期刊编委。
学习工作经历
(一) 学习经历
2001.09-2005.03中国科学院海洋研究所 海洋生物学 理学博士(中美联培)
2002.09-2004.10获中国国家留学基金(CSC)和美国国家科学基金(NSF)联合资助在美国密歇根大学(University of Michigan, Ann Arbor) 分子细胞与发育生物学系(MCDB)完成博士学位论文
1996.09-1999.07西南农业大学 生物化学与分子生物学 理学硕士
1982.09-1986.07 四川大学 生物系 动物学本科毕业 理学学士
(二)工作经历
2020.07-至今 西南大学 水产学院 教授 博士生导师
2010.12-2020.07 西南大学 动物科技学院 教授 博士生导师
2009.01-2016.09 国家级动物科学实验教学示范中心 主任
2006.04-2016.03 西南大学 动物科技学院 副院长
2001.07- 2005.07西南大学 水产与水文学院 晋升教授 硕士生导师
1986.07-2001.07 西南农业大学 水产科学系 历任助教、讲师、副教授
教学工作
水产动物遗传育种课程组负责人。主讲本科生“水产动物遗传育种学”(获重庆市一流本科课程、思政---科技伦理示范建设课程)、 “水产专业英语” 、研究生 “现代水产科技进展”、 “分子生物学研究技术”(校级研究生线上精品课程)、“高级鱼类生理学(双语)” 等课程。领衔成功申报建成西南大学首个国家级动物科学实验教学示范中心并任中心主任(2009.01-2016.09);领衔成功申报重庆市水产养殖学市级特色专业(2011.10)、重庆教委本科高校“三特行动计划”水产养殖学特色专业(2013.12);西南大学国际学院全英文水产养殖硕士项目负责人(2014)。主持完成多项重庆市级、校级提升研究生质量工程项目。
主编中国农业出版社“十三五”规划教材《水产专业英语》,参编本科部级规划教材《水产动物遗传学》(中国农业出版社)、研究生规划教材《渔业案例分析与研讨》(高等教育出版社)。主编《动物科技学院史》(2015.08, 西南大学组建10周年暨办学110周年丛书,ISBN978-7-5621-7774-6)。
研究生培养
(一)研究生招生
硕士生招生专业:水产养殖、渔业资源、渔业(专硕)
博士生招生专业:水产养殖(水产生物技术育种)
博士后流动站招收学科:水产、生物学。
欢迎校内外学生报考本实验室研究生。招收的学生将安排系统的专业理论学习,接受现代生物技术实验方法和渔业资源调查等科研实践训练,并依学生个人潜质、生涯规划制定个性化的培养目标和学习计划。
(二)在读研究生:
硕士生:杜春莹、聂臻韬、欧阳铧鑫、江善文、 张思凌、任杰、张小雪、朱志、陈艳玲、蔡丽娟。
博士生:陶怡曦、冯婧昀、苗晓敏。
毕业研究生:博士、硕士61名。出站博士后4名。
联系方式
通讯地址:400715 重庆市北碚区天生路2号 西南大学水产学院
联系方式: 023-68251962(Lab); liyunlab@aliyun.com
渔业与水产生物技术实验室:北碚校区30教学楼(阳初楼)103、104、105室(实验大楼)
科学研究
(一)研究工作
团队研究特色:围绕国家水产种业振兴战略,以需求为导向,聚焦“种质创制”目标,开展长江经济鱼类种质收集保存、优良性状发掘解析、新种质创制、精准育种等应用基础研究和核心技术研发,产学研协作开展成果转化。本实验室主要研究方向:
(1)鱼类精准育种技术研发与新种质创制。
(2)鱼类胚后发育性状的分子机制解析。
(3)长江上游鱼类种质资源保护与多样性研究。
(二)研究平台
建有西南大学水产工程技术研究中心,领衔的水产遗传育种与资源利用研究团队在水产生物基础研究、应用研究和成果转化方面有长期的学术积累和丰富的技术成果。有560平米的实验室,1200平米的鱼类繁育与工厂化养殖系统,120平米模式生物斑马鱼房,经济实验鱼房、孵化鱼房。具备开展鱼类发育遗传、精准育种、分子细胞、生理生态、资源生物学研究的技术条件平台。团队成员还加盟西部(重庆)科学城种质创制大科学中心(金凤实验室)水产资源板块开展研究工作。
(三)主要成果
1. 主持科研项目:目前主持有重庆市水产科技创新联盟重点攻关项目“鳜鱼优质育种素材创制与新品种培育”、重庆市发改委长江上游种质创制与利用工程研究中心培育项目“长江鳜鱼资源保存繁育与种质创制”、重庆市渔业资源增殖放流效果评价专项、重庆市长江流域水生生物资源监测专项等在研科研项目。
先后主持完成国家自然科学基金,国家重点基础研究发展计划生殖与发育子课题,农业农村部长江水生生物完整性评价专项、重庆市重点研发项目三峡库区生态渔业关键技术等国家、部省级及横向科研项目70余项。主持完成《重庆市“十四五”渔业发展规划》编制项目(已颁布),制定重庆市渔业地方标准4项。为国家、省市各级政府部门和企业提供被采纳的资政报告20余份。
2. 主要理论和技术成果:
(1)基于发育遗传、生殖干细胞、基因组代谢组、CRISPR/Cas9基因编辑技术,对斑马鱼生殖、代谢、免疫、应激相关10余个重要基因建立了敲除纯合突变体,进行了功能解析。
(2)在斑马鱼发育遗传研究平台基础上,建立了鳜鱼性别控制、生殖干细胞、全基因组GWAS精准育种技术平台,在鳜鱼生殖发育、优良性状遗传解析、新种质创制方面进行深入研究。
(3)持续开展三峡库区水生生物资源监测和水产种质资源保护研究。
在《Aquaculture》 《Fish & Shellfish Immunology》 《Journal of Biological Chemistry》 《Free Radical Biology and Medicine》 《Fish Physiology and Biochemistry》 《Biology》 《水产学报》 《水生生物学报》 《海洋与湖沼》 《淡水渔业》等期刊发表论文115篇,其中SCI论文45篇,CSCD论文 43篇。
主要学术论文选录(*通讯作者)
[1] Xu H, Mao XY, Nie ZT, Li Y *. Oxr1a prevents the premature ovarian failure by regulating oxidative stress and mitochondrial function in zebrafish. Free Radical Biology and Medicine. 2023, 203:102-113. https://doi.org/10.1016/j.freeradbiomed.2023.04.002 (IF8.1)
[2] Xu H, Wang WB, Ouyang HX, Zheng XX, Miao XM, Feng JY, Tao YX, Li Y*. Expression profiling and antibacterial analysis of cd36 in mandarin fish Siniperca chuatsi. Fish & shellfish Immunology, 139 (2023) 108901. https://doi.org/10.1016/j.fsi.2023.108901 (IF4.7)
[3] Li S, Guo H, Du CY, Tao YX, Feng JY, Xu H, Pang X, Li Y*. Effect of temperature on exercise metabolism, hypoxia tolerance, and RNA-seq analysis in Sinilabeo rendahli from the Yangtze River, China. Frontiers in Ecology and Evolution. 2023, 11:1159161. doi:10.3389/fevo.2023.1159161(IF4.493)
[4] Tao YX, Du CY, Duan BC, Wang WB, Guo H, Feng JY, Xu H, Li Y*. Eugenol exposure inhibits embryonic development and swim bladder formation in zebrafish. Comparative Biochemistry and Physiology, Part C. Part C. 2023,268,109602. https://doi.org/10.1016/j.cbpc.2023.109602 (IF4.52)
[5] Miao XM, Guo H, Song Y, Du CY, Feng JY, Tao YX, Xu H, Li Y*. Improvement of flesh quality of farmed silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) by short-term stocked in natural water. Fishes. 2023,8,142. https://doi.org/10.3390/fishes8030142 (IF3.170)
[6] Xu H, Wang WB, Nie ZT, Miao XM, Li Y*. Delayed first feeding chronically impairs larval fish growth performance, hepatic lipid metabolism, and visceral lipid deposition at the mouth-opening stage. Marine Biotechnology. 2023, 25:140–149 https://doi.org/10.1007/s10126-022-10187-z (IF3.727)
[7] Yang H, Pu Y, Liu CS, Gao L, Duan XB, Liu SP, Chen DQ, Zhong LQ, Li Y*. Environmentally relevant concentrations of tris (1,3-dichloro-2-propyl) phosphate induce growth inhibition and oxidative stress in silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) larvae. Ecotoxicology and Environmental Safety.241(2022) 113798 https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2022.113798 (IF7.129)
[8] Xu H, Miao XM, Wang WB, Wang G, Li Y*. Transcriptome anslysis reveals the early resistance of zebrafish larvae to oxidative stress. Fish Physiology Biochemistry. 2022(48):1075-1089 (IF 3.014) http://doi.org/1001007/s10695-022-01100-5 (IF3.014)
[9] 何春,邓华堂,王果,刘寒文,沈子伟,刘绍平,段辛斌,陈大庆, 李云*. 基于氮同位素分析的三峡水库主要鱼类营养级研究. 渔业科学进展,2022,43(4):116-126. https://doi.org/10.19663/j.issn2095-9869.20210913002
[10] 陈辙聿,陶怡曦,叶勤,王果,王文波,范士琦,何春,李云*. 三峡库区短颌鲚(Coilia brachygnathus)新建种群的年龄结构、生长特性及遗传多样性分析. 海洋与湖沼,2022,53(2):430-439. doi:10.11693/hyhz20210900217
[11] Jiang Y, Yang MY, Ye Q, Tao YX, Xu H, Li Y*. The effect of hypoxia on heart and vascular morphological development and related genes expression in zebrafish embryos(低氧对斑马鱼胚胎心脏和血管发育及相关基因表达的影响). 水生生物学报. 2022,46(1):106-115. http://doi.org/1010.7541/2021.2020.263
[12] Xie L, Chen ZY, Guo H, Tao YX, Miao XM, Wu RH, Li Y*. Congenital asplenia interrupts immune homeostasis and leads to excessive systemic inflammation in zebrafish. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2021, 11,668859. doi:10.3389/fcimb.2021.668859. (IF6.073)
[13] Ge HL, Zhang HY, Zhao QY, Li F, Gu HR, Liu SY, Yang HB, Li Y*, Wang ZJ*. Construction of a full-length transcriptome resource for the Chinese sucker (Myxocyprinus asiaticus), a rare protected fish, based on isoform sequencing (Iso-Seq). Frontiers in Marine Science. 2021, 8: 699504. doi: 10.3389/fmars.2021.699504(IF5.249)
[14] Xu H, Wang G, Chi YY, Kou YX, Li Y*. Expression profiling and functional characterization of the duplicated Oxr1b gene in zebrafish. Comparative Biochemistry and physiology-Part D: Genomics and Proteomics.2021, 39,100857. https://doi.org/10.1016/j.cbd.2021 (IF3.306)
[15] Xu H, Fan SQ, Wang G, Miao XM, Li Y*. Transcriptome analysis reveals the importance of exogenous nutrition in regulating antioxidant defenses during the mouth-opening stage in oviparous fish. Fish Physiology and Biochemistry. 2021,47:1087-1103. https://doi.org/10.1007/s10695-021-00954-5 (IF3.014)
[16] Li S, Guo H, Chen ZY, Jiang Y, Shen JY, Pang X, Li Y *. Effects of acclimation temperature regime on the thermal tolerance, growth performance and gene expression of a cold-water fish, Schizothorax prenanti. Journal of Thermal Biology, 2021, 102918. https://doi.org/10.1016/j.jtherbio.2021.102918 (IF3.189)
[17] Xu H, Jiang Y, Miao XM, Tao YX, Xie L, Li Y*. A model construction of Starvation induces hepatic steatosis and transcriptome analysis in zebrafish larvae. Biology, 2021, 10, 92. http://doi.org/10.3390/biology10020092 (IF5.168)
[18] He C, Deng HT, Ba JW, Li S, Chen ZY, Tao YX, Duan XB, Liu SP, Li* Y, Chen DQ*. Food Chain length associated with environmental factors affected by large dam along the Yangtze River. Water, 2020,12,3157. https://www.mdpi.com/2073-4441/12/11/3157 (IF3.103)
[19] Xu H, Jiang Y, Li S, Xie L, Tao YX , Li Y*. Zebrafish oxr1a knockout reveals its role in regulating antioxidant defenses and aging. Genes, 2020.11,1118. http://www.mdpi.com/2073-4425/11/10/1118 (IF4.096)
[20] Wu RH, Zhang Q, Li Y*. Development, characterization of monoclonal antibodies specific for the ORF25 membrane protein of Cyprinid herpesvirus 2 and their applications in immunediagnosis and neutralization of virus infection. Aquaculture, 2020, 519, 734904. https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2019.734904 (IF3.224)
[21] Wu RH, Shen JY, Lai XL, He T, Li Y*. Development of monoclonal antibodies against serum immunoglobulins from gibel carp (Carassius auratus gibelio) and their applications in serodiagnosis of inapparent infection and evaluation of vaccination strategies. Fish & Shellfish Immunology, 2020, 96, 69-77. https://doi.org/10.1016/j.fsi.2019.11.059 (IF4.581)
[22] Xie L, Tao YX, Wu RH, Xu H, Li Y* Congenital asplenia due to a tlx1 mutation reduces resistance to Aeromonas hydrophila infection in zebrafish. Fish & Shell fish Immunology, 2019, 95, 538–545. https://doi.org/10.1016/j.fsi.2019.10.065. (IF3.451)
[23] 英士娟,陶怡曦,胡颖雄,杨 帆,段必成,王军红,李 云*. 三峡水库水域牧场鲢放流后对环境的生理适应. 淡水渔业,2019,49(2):9-13.
[24] Chen HJ, Wang DQ, Duan XB, Liu SP, Chen DQ*, Li Y*. Hatchery-reared enhancement program for silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) in the middle Yangtze River: monitoring the effectiveness based on parentage analysis. 2019,Peer J, e6836 http://doi.org/10.7717/peerj.6836(IF2.379)
[25] Chen HJ, Wang DQ, Guo J, Duan XB, Liu SP, Chen DQ*, Li Y*. Monitoring the genetic effects of broodstock enhancement of silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) in middle Yangtze River based on cytb gene and D-loop sequences. Journal of Freshwater Ecology, 2019, 34:1, 323-332. https://doi.org/10.1080/02705060.2019.1588795(IF1.239)
[26] Yang F, Tao YX, Duan BC, Zhang Q, Zhai XL, Li Y*. Complete mitochondrial genome of the Yangtze grenadier anchovy, Coilia Brachygnathus (Clupeiformes: Engraulidae) from the upper Yangtze River. Mitochondrial DNA Part B, 2019, 4(1):1140-1141. https://doi.org/10.1080/23802359.2019.1591181 (IF0.885)
[27] Deng HT, Li Y*, Liu MD, Duan XB, Liu SP Chen DQ*. Stable Isotope Analysis Reveals the Importance of Riparian Resources as Carbon Subsidies for Fish Species in the Daning River, a Tributary of Three Gorges Reservoir, China. Water, 2018,10,1233. https://doi.org/10.3390/w10091233 (IF2.524)
[28] 李晓洁,唐敏,李云*,叶勤,薛洋,靳涛,祖学勤. 鲢鳙在长寿湖水生态系统氮磷循环中的作用. 淡水渔业,2018, 48(3):40-46.
[29] 丁晨雨,胡利双,李云*,薛 洋,李 虹,吴荣华,刘恩秀,李晓洁. 低氧胁迫对鲢心肌细胞凋亡及其调控基因Bax、Bcl-2表达的影响. 淡水渔业,2018,48(2):10-15.
[30] Xu H, Liu EX, Li Y*, Li XJ, Ding CY. Transcriptome Analysis Reveals Increases in Visceral Lipogenesis and Storage and Activation of the Antigen Processing and Presentation Pathway During the Mouth-opening Stage in Zebrafish Larvae. International Journal of Molecular Sciences, 2017, 18(8), 1634. https://doi.org/10.3390/ijms18081634 (IF3.687)
[31] 徐浩, 罗茜, 李云*, 薛洋, 叶勤. 环境DNA研究技术及其在生态学领域的应用. 生物技术通报. 2014, (10):49-55.
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[36]L i Y, Xiang JH, Duan CM.Targeted knockdown reveals that IGF binding protein-3 (IGFBP-3) is involved in peripheral nerves development in zebrafish embryos. 13th International Congress on Genes, Gene Families and Isozymes & 2005 Forum on Fishery Science and Technology. Shanghai, P.R. China. Sep. 17-21, 2005, P-61.
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[38] Schlueter PJ, Li Y, Laser B, Royer TR, Chan SJ, Steiner DF, Duan CM*. Targeted knock-down of the two zebrafish IGF-I receptor genes reveals novel functions of IGF signal in eye, inner ear, and heart formation. The Endocrine Society's 85th Annual Meeting. Philadelphia, Pennsylvania. June 19-22, 2003. P3-365.
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